石墨是不可再生的稀有礦產，廣泛應用于現代工業，是重要的戰略資源。歐盟將石墨的加工產成品石墨烯列為未來新興旗艦技術項目，并把石墨列為14種“生死攸關”的緊缺礦產資源之一。美國將石墨資源列為高新技術產業的關鍵礦物原料。我國石墨儲量占世界70%，是世界最大的石墨儲量與出口國。但在生產過程中長期存在著開采浪費、資源利用率不高、環境破壞嚴重等問題，資源的稀缺性與環境的外部成本沒有體現真實價值。問題主要表現在以下方面：
一是資源稅亟需調整。稅率偏低：我國現行石墨資源稅為每噸3元，稅負過輕，未體現資源的稀缺性與環境的外部成本。與礦產稀缺性及重要性相似的稀土相比，稀土資源稅改革后，不僅單列了稅目，而且稅率上調了10倍以上。比較而言，石墨資源稅稅率偏低。稅率單一：現行的資源稅暫行條例中石墨礦稅率單一，沒有按照石墨品質等級、種類等劃分，不能體現資源稅的調節級差收入的功能。按銷量計征不科學：按銷售量從量計征，而不是以實際開采的礦產數量計征，沒有考慮到對環境破壞的補償、資源的合理開發、開發成本及資源耗竭等問題。
二是出口過于輕率。中國是世界最大的天然石墨生產國，也一直是天然石墨產品的最大出口國。與我國對石墨資源過度開采形成鮮明對照的是，在石墨深加工產品技術上領先的發達國家對天然石墨實行“以購代采”的戰略，并且進行技術封鎖。作為中國最大石墨市場的日本，進口量占中國總出口量的32.6%，并將進口的部分石墨礦沉入海底；韓國則封存了本國石墨礦山不開采，趁我國產品低價競銷之機大量進口；美國每年進口量約占中國總出口量的10.5%，而對本國的石墨資源進行了立法保護。
三是加工過于粗放。石墨的性能與其鱗片的大小有著十分密切的關系，不同尺寸大小的鱗片石墨具有不同的用途，加工處理方式和應用領域也就不同。目前國內對不同特征的石墨礦石工藝學研究缺乏，沒有查清不同鱗片尺寸的石墨資源分布狀態，也沒有相應的深加工方法。石墨選礦回收率低，大鱗片石墨產率低。資源特征不清，加工方法單一，結果造成加工過程中大尺寸鱗片石墨得不到有效保護，小尺寸鱗片石墨得不到有效利用，造成了寶貴戰略資源的巨大浪費。
四是進出口價差驚人。我國生產的天然石墨產品中絕大部分是最初級的加工產品，高附加值產品研發和生產明顯缺失。以高純石墨為例，國外以其技術優勢在高純石墨方面占據領先地位，并在石墨高技術產品方面對我國進行封鎖。目前我國高純石墨技術只能勉強達到純度99.95%，而99.99%乃至以上的純度只能全部依賴進口。2011年，我國天然石墨均價約為4000元/噸，而進口99.99%以上高純石墨的價格超過20萬元/噸，價差非常驚人。
為此建議：
一、調整石墨資源稅計征方式，完善價格形成機制，讓石墨生產價格體現出環境成本。現行石墨資源稅采取按照銷售量從量計征方式，建議調整為以開采額征稅。這樣企業在生產過程中勢必要注重提高開采率及控制開采量對產品成本進行控制，采富棄貧、資源浪費等現象能夠得到抑制。此外，石墨產品需求彈性較小，稅負容易轉嫁，在對石墨資源稅設計稅負時，要考慮到國外品級相似產品到岸價格與關稅價格和不應低于提高資源稅之后國內的石墨產品價格，避免削弱我國石墨產品的國際競爭力。
二、加強對石墨資源的管理與整合。一方面加強對優質石墨資源勘查開發的有效監管。提升管理層級，加速行業整合，提升企業的競爭力與產品定價權。參照稀土行業整合由國家工信部牽頭參與，對石墨行業應該提升管理層次，從地方政府提升到省部層面，加強國家對石墨行業的有效管理與調控。另一方面提升行業集中度，提高國家對優質資源的掌控力度限制開采，建立石墨戰略儲備制度，包括石墨產品儲備、產能儲備和優質礦產地儲備。盡早對石墨實施出口配額許可制度，并逐步減少石墨出口配額，減少或者禁止原礦及初級產品出口，加強對石墨出口管控。
三、開采要體現環境成本，提高資源利用率。石墨行業環境污染問題突出，水土流失、粉塵煙塵、廢石廢渣嚴重污染土地、地表水系及礦區的生態環境，而開發造成的環境成本并未列入現行成本。建議加大石墨開采的環境成本，將這部分資金用于后續環境治理，以此倒逼石墨企業調整產品結構，避免粗放開采，進行行業資源整治，設立生產分級制度，提高資源利用率。
四、加快高附加、高技術石墨科技成果研發與應用。針對發達國家不斷致力于提高技術水平來開發石墨新產品和新用途，形成寡頭壟斷的這種態勢，建議制定高標準的石墨企業準入門檻，強化高附加、高技術石墨科技成果轉化應用。建設國家級技術研究開發中心，培育石墨開發應用技術創新體系和自主的技術與人才培育體系。加快轉變石墨企業生產經營方式，大力培育和壯大石墨乳、石墨電極、石墨烯等現代產品主體。完善石墨產品流通市場體系，拓展對外流通市場渠道。建立健全石墨行業新標準化體系和石墨產品分級和進出口監管體系。